Почему на грядке рассада помидор перестала расти.

В этом году, как всегда, в начале апреля посеяла семена помидор на рассаду в небольшой парничок. К середине мая рассада поднялась не высокая, но крепкая, красивая. Высадила её на грядки, но она не росла. Листья потемнели и стали почти чёрными, а корни были вялыми и не развивались. Только к концу июня рассада стала оживать, зеленеть, расти и набирать силу, цвести, естественно помидоры созрели поздно. Вот только незначительный нюанс. У нас небольшое хозяйство. Несколько кроликов и куры, которых держим сезонно, только в летний период. Осенью, очищая клетки, содержимое перекладывали на грядки. Могло ли оно за зиму не перегореть и так негативно сказаться на рассаде?